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    數據、算法、好基友:智能算法如何突破醫藥研發

    本文作者: AI科技評論 2016-05-10 10:24
    導語:兩位同名、同姓、志同道合的創始人,除了有一家奇葩的醫藥公司,還有一個奇葩的相遇故事。

    數據、算法、好基友:智能算法如何突破醫藥研發 Andre M. Radin(左)和Andrew A. Radin(右),同名同姓的巧合讓他們走到了一起。圖片:AndrewRadin.com

    醫藥研究員多年來一直使用計算機幫助他們開發新藥,例如用來建立分子模型或分析醫療記錄。這讓研究員們可以提出藥物治療的新想法,有時候,一下子就有幾千個新想法。研究員然后制造并測試藥物——現在培養皿,然后用動物,然后,如果藥物試驗結果一路都不錯,就在人類身上測試。這個過程有可能得花十年時間、甚至更久,同時花費數十億美元,這意味著要治療癌癥、糖尿病和帕金森,依然是路漫漫其修遠。

    位于美國加州Palo Alto的創業公司twoXAR希望通過讓智能算法來測試海量的備選藥物,來縮短這條漫長之路。公司創始人的背景是計算機科學,而非醫藥研究,他們說自己有得天獨厚的能力來實現人工智能藥物。

    “我們來看看汽車行業,”twoXAR創始人及CEO Andrew Radin說,“如果你叫一個汽車工程師來讓汽車變得更安全,他會提出安裝安全第一、氣囊、防鎖剎車等等裝置。但是如果你讓軟件工程師來干,他會說‘我們把司機換掉吧’。無人車并不是GM或者福特公司最早提出的。

    “計算機可以實現很多,”twoXAR聯合創始人及公司首席商務官Adnrew Radin說,“但是他們通常是為研究員的工作帶來補充。在進行藥物研發的人們是生命科學家、化學家、分子生物學家;他們建造分子模型,然后決定測試哪些模型,而不是讓計算機來處理數據然后決定哪些模型可以進一步研究?!?/p>

    眼尖的你也許已經注意到了上文的奇怪之處,提示:就在兩位公司創始人的職位介紹旁邊。沒有打錯字哦,兩位創始人就是同名同姓:都叫Andrew Radin。實際上公司名字twoXAR的意思就是“Andrew Radin乘以二”。兩位Andrew:CEO Andrew A. Radin和CBO Andrew M. Radin——互相認識的方式也像他們的藥物開發新方法一樣奇葩。

    數據、算法、好基友:智能算法如何突破醫藥研發

    圖片來源:IEEE Spectrum

    同名同姓的巧合

    十年前,Andrew A.收購了網絡域名AndrewRadin.com。2008年,Andrew A.收到了一位名叫Andrew M的陌生人的郵件,希望收購該域名?!拔艺f不,泥奏凱,然后他一直說你不用的話就賣給我嘛。我最后不得不簡單粗暴地甩掉他?!?/p>

    當時,Andrew A.已經從羅切斯特理工學院獲得了計算機科學本科和碩士學位,已經在硅谷住了一段時間,在創業公司工作,同時也建立自己的創業項目。Andrew M從加州大學圣地亞哥分校獲得了生物化學和細胞生物學的本科學位,同時也有一個經濟學雙學位,他當時在投資銀行工作,正考慮攻讀MBA。

    大約一年后,Andrew M.想惡搞一下,在Facebook上建立了一個Andrew Radin粉絲群;全國有幾位Andrew Radin都加了群,Andrew A.也是其中之一。因此兩位同名同姓的人在社交媒體上又相遇了,雖然Andrew A.一直將Andrew M.視作想買下自己域名的“壞銀”。

    2010年,Andrew A.在中國旅游了一個月,在Facebook上發了個圖。他回國幾個月后,Andrew M.去中國學習了六個月中文,在Facebook上給他發了消息問能不能給他一些在中國旅游的建議。結果,兩人在電話上聊了幾個小時。Andrew A.回憶說:”就是那時候他在我腦海里的印象改變了,不是個‘壞銀’?!?/p>

    兩位主角的下一次對話是3年后。Andrew A.在斯坦福攻讀生物信息學,而Andew M.是MIT的研究生。

    “我的一個MIT同學要去硅谷做一次學習訪問,”Andrew M.說,“所以我聯系了Andrew A.,請他坐下聊聊他的創業經歷;這是我們第一次面對面見面。”

    從此,兩位Andrew成為了好朋友。而twoXAR的成立則是另一則故事。

    Andrew A.在Nortel Networks和America Online分別參與了軟件開發工作,但后來加入了硅谷的創業大軍,從2004年到2013年,他在“各種不同行業”創業公司作為CTO,據他回憶其中包括了“打電話的、做電子游戲的、做廣告的還有做地圖的?!皼]有一家是獨角獸公司,"雖然地圖公司Locationary被蘋果收購,此次收購讓他獲得了足夠的經濟收益,可以一段時間不用工作。

    2013年的時候,他不再想參與技術上挺有趣、但是產品不夠震撼力的項目,而是想做一些有意義的事情。最初,他考慮了流浪漢的問題,但是他的妻子鼓勵他做些別的,“讓你的技能可以發揮影響的事情。“他最終選擇了生物化學信息學,也就是,利用計算機科學來解決醫學問題。他感覺自己需要回到學校來學習更多關于該領域的知識,他參與了斯坦福的項目。

    與此同時,比Andew A.小13歲的Andrew M.一直心里癢癢想要創業。他說:”我的目標一直是開一家生物科技公司。我在高中的時候在做遺傳工程,選擇了加州大學圣迭戈分校是因為學校誕生了很多生物科技創業公司;我主修了生物化學和經濟學?!盇ndrew M的第一份工作是一家專注在科技投資領域的銀行;然后他加入了MIT斯隆商學院攻讀研究生,注重創業領域。

    因此,2014年兩位Andrew又多了一個共同點:他們都在讀研究生。

    數據、算法、好基友:智能算法如何突破醫藥研發

    圖片來源:AndrewRadin.com

    寫論文,還是寫專利?

    在斯坦福,Andrew A上了一門課BMI217,作業是提出一個可以用計算機解決的醫學問題。他想出了一種方法,利用數據科學來發現新藥。最終,這個想法演變成一算法,用來整合、分析各個獨立的生物醫學數據庫,來預測什么藥物最可能在某種疾病療法的測試中成功。數據庫包括但不限于醫療記錄搜索(分析使用某種疾病的人的醫療記錄,來看是否有某種別的疾病水平異常低,意味著治療有效)、分子相似度模型(關注已經在使用中的藥物,試圖發現其他具有類似結構的物質)以及基因表達信息(研究某種基因特征,將其與已知分子進行匹配)。

    它其實是一種工具,可以在巨大的、獨立的數據庫之間比較聯系,從噪音中分離出信號?!?/strong>他說。該技術可以結合不限數量的公開及專利數據庫,將某種藥物質量某種疾病的成功率進行排名。

    最初,他只打算簡簡單單寫篇論文。然后他與V. Paul Lee一起吃午飯,lee是Electronic Arts的前總裁,曾在Andrew A的一些創業項目中投資。“Paul用‘你個蠢貨’的眼神看著我并說:‘如果你寫個論文,結果什么也不會實現不了;如果你想實現點什么,你不該寫論文,而是寫個專利申請,然后建立一家公司。”

    因此,他就花了幾個月琢磨這個問題:寫論文還是寫專利?他與Andrew M.在電話聊天,考慮了自己困境,咨詢Andrew M基于該技術能不能建造一家公司。Andrew A回憶道:“他告訴我來波士頓,和MIT的教授們討論一下?!彼?014年6月真的去了。

    教授們幫兩位Andrew看清了道路,這的確可以成為一個商業機會。他們在MIT的某次查爾士河泛舟活動上,最終決定了創立twoXAR公司。7月,Andrew M搬來了硅谷——暫時與Andrew A夫婦住在一起。

    如今,twoXAR有了10名員工、430萬風險投資和一間棒棒的辦公室。他們還在招聘,希望到年底增加幾位數據科學與生物信息科學的關鍵員工。

    公司在研究院和生物醫藥公司利用現有藥物測試了他們的預測算法,用算法處理數據庫,看看算法得出的優選藥物名單中是否有這些現有的藥物。目前,他們已經用超過40種疾病進行了評估,包括癌癥、自動免疫疾病和神經紊亂疾病?;谶@些測試,他們為最初的工作定下四個領域,公司還未對外公布。在這些領域內,他們已經進行了藥物預測,開始在動物中測試化合物。此刻,兩位Andrew還沒計劃將算法賣給醫藥公司;他們認為,醫藥公司的內部文化已經根深蒂固,對于利用計算機算法來驅動決策會保持懷疑態度。他們努力打造自己的藥物產品線,通常與研究機構一起合作。

    他們稱公司已經與學術界和商業機構簽訂了一些合作項目,但是只有一項目前是公開的。twoXAR上個月宣布與斯坦福大學醫學院的皮膚病系合作,識別針對淋巴系統疾病、單純型大皰性表皮松解(EBS)和其他罕見疾病的藥物。

    Andew A說,現在“有很好的機會,來為疾病找到更加精確的藥物,無論是流行疾病還是罕見疾病,有可能現有治療方法不夠有效,或者現在尚未有治療方法。目前,藥物研發還是違反摩爾定律的——要發現新藥從算法上來說越來越難,成本越來越高。

    TwoXAR想要改變這一局面。

    如果你還記得N年以前關于在線域名的那檔子事——兩個Andrew有了一個共同網站:AndrewRadin.com。

    via IEEE Spectrum

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